Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XIRP1Q702N8 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XIRP1Q702N8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XIRP1Q702N8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XIRP1Q702N8 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XIRP1Q702N8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XIRP1Q702N8 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XIRP1Q702N8 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XIRP1Q702N8 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XIRP1Q702N8 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms