Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms