Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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FAM46CQ5VWP2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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FAM46CQ5VWP2 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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FAM46CQ5VWP2 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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FAM46CQ5VWP2 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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FAM46CQ5VWP2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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