Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms