Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms