Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI83

KRTAP24-1, Keratin-associated protein 24-1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP24-1Q3LI83 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
KRTAP24-1Q3LI83 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP24-1Q3LI83 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP24-1Q3LI83 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP24-1Q3LI83 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP24-1Q3LI83 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP24-1Q3LI83 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP24-1Q3LI83 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP24-1Q3LI83 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP24-1Q3LI83 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP24-1Q3LI83 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP24-1Q3LI83 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP24-1Q3LI83 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP24-1Q3LI83 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP24-1Q3LI83 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP24-1Q3LI83 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP24-1Q3LI83 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP24-1Q3LI83 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP24-1Q3LI83 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP24-1Q3LI83 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP24-1Q3LI83 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP24-1Q3LI83 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP24-1Q3LI83 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP24-1Q3LI83 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP24-1Q3LI83 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP24-1Q3LI83 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP24-1Q3LI83 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP24-1Q3LI83 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP24-1Q3LI83 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP24-1Q3LI83 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP24-1Q3LI83 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP24-1Q3LI83 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP24-1Q3LI83 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP24-1Q3LI83 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP24-1Q3LI83 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP24-1Q3LI83 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP24-1Q3LI83 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP24-1Q3LI83 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP24-1Q3LI83 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP24-1Q3LI83 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP24-1Q3LI83 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms