Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms