Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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GABRA6Q16445 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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GABRA6Q16445 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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GABRA6Q16445 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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GABRA6Q16445 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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GABRA6Q16445 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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GABRA6Q16445 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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