Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
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