Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSHL1Q14406 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSHL1Q14406 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSHL1Q14406 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSHL1Q14406 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSHL1Q14406 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSHL1Q14406 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSHL1Q14406 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSHL1Q14406 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSHL1Q14406 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSHL1Q14406 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSHL1Q14406 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSHL1Q14406 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CSHL1Q14406 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSHL1Q14406 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSHL1Q14406 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CSHL1Q14406 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSHL1Q14406 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSHL1Q14406 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSHL1Q14406 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSHL1Q14406 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSHL1Q14406 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSHL1Q14406 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSHL1Q14406 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSHL1Q14406 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSHL1Q14406 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSHL1Q14406 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSHL1Q14406 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSHL1Q14406 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSHL1Q14406 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSHL1Q14406 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSHL1Q14406 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSHL1Q14406 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSHL1Q14406 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CSHL1Q14406 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CSHL1Q14406 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CSHL1Q14406 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms