Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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