Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CBFBQ13951 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms