Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 340.8 ms