Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
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CHAF1AQ13111 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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CHAF1AQ13111 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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CHAF1AQ13111 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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CHAF1AQ13111 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
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CHAF1AQ13111 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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CHAF1AQ13111 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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