Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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BNIP1Q12981 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
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BNIP1Q12981 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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BNIP1Q12981 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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BNIP1Q12981 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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