Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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GTF3C1Q12789 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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GTF3C1Q12789 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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GTF3C1Q12789 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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GTF3C1Q12789 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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GTF3C1Q12789 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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GTF3C1Q12789 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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GTF3C1Q12789 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
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GTF3C1Q12789 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF3C1Q12789 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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