Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms