Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms