Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FMODQ06828 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FMODQ06828 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FMODQ06828 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FMODQ06828 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FMODQ06828 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FMODQ06828 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FMODQ06828 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FMODQ06828 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FMODQ06828 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FMODQ06828 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FMODQ06828 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FMODQ06828 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FMODQ06828 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FMODQ06828 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FMODQ06828 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FMODQ06828 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FMODQ06828 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FMODQ06828 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FMODQ06828 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FMODQ06828 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FMODQ06828 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FMODQ06828 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FMODQ06828 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FMODQ06828 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FMODQ06828 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FMODQ06828 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FMODQ06828 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FMODQ06828 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FMODQ06828 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FMODQ06828 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FMODQ06828 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FMODQ06828 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FMODQ06828 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FMODQ06828 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FMODQ06828 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FMODQ06828 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FMODQ06828 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FMODQ06828 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FMODQ06828 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FMODQ06828 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FMODQ06828 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FMODQ06828 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FMODQ06828 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FMODQ06828 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FMODQ06828 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FMODQ06828 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FMODQ06828 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FMODQ06828 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FMODQ06828 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FMODQ06828 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FMODQ06828 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FMODQ06828 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FMODQ06828 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FMODQ06828 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FMODQ06828 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FMODQ06828 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FMODQ06828 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FMODQ06828 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FMODQ06828 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FMODQ06828 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FMODQ06828 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms