Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TLE4Q04727 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TLE4Q04727 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TLE4Q04727 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TLE4Q04727 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TLE4Q04727 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TLE4Q04727 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TLE4Q04727 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TLE4Q04727 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TLE4Q04727 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TLE4Q04727 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TLE4Q04727 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TLE4Q04727 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TLE4Q04727 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
TLE4Q04727 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
TLE4Q04727 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TLE4Q04727 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TLE4Q04727 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TLE4Q04727 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TLE4Q04727 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TLE4Q04727 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TLE4Q04727 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TLE4Q04727 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TLE4Q04727 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TLE4Q04727 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TLE4Q04727 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TLE4Q04727 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TLE4Q04727 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TLE4Q04727 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TLE4Q04727 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TLE4Q04727 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TLE4Q04727 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TLE4Q04727 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TLE4Q04727 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TLE4Q04727 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TLE4Q04727 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TLE4Q04727 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TLE4Q04727 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TLE4Q04727 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TLE4Q04727 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TLE4Q04727 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TLE4Q04727 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TLE4Q04727 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TLE4Q04727 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TLE4Q04727 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TLE4Q04727 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TLE4Q04727 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLE4Q04727 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLE4Q04727 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLE4Q04727 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLE4Q04727 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLE4Q04727 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms