Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms