Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRB1P82279 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRB1P82279 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB1P82279 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB1P82279 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB1P82279 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB1P82279 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB1P82279 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB1P82279 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB1P82279 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB1P82279 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB1P82279 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB1P82279 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB1P82279 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB1P82279 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB1P82279 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB1P82279 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB1P82279 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB1P82279 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB1P82279 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB1P82279 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB1P82279 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB1P82279 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB1P82279 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB1P82279 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB1P82279 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB1P82279 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB1P82279 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB1P82279 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB1P82279 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB1P82279 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB1P82279 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB1P82279 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB1P82279 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB1P82279 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB1P82279 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB1P82279 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB1P82279 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB1P82279 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB1P82279 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB1P82279 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB1P82279 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB1P82279 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB1P82279 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB1P82279 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB1P82279 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB1P82279 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB1P82279 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB1P82279 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB1P82279 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB1P82279 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB1P82279 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB1P82279 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB1P82279 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB1P82279 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB1P82279 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB1P82279 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB1P82279 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB1P82279 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB1P82279 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB1P82279 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB1P82279 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB1P82279 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB1P82279 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB1P82279 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB1P82279 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB1P82279 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB1P82279 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB1P82279 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB1P82279 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB1P82279 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB1P82279 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB1P82279 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB1P82279 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB1P82279 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB1P82279 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB1P82279 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB1P82279 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB1P82279 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRB1P82279 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRB1P82279 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRB1P82279 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRB1P82279 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRB1P82279 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRB1P82279 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRB1P82279 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRB1P82279 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRB1P82279 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRB1P82279 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRB1P82279 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRB1P82279 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CRB1P82279 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRB1P82279 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRB1P82279 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CRB1P82279 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRB1P82279 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CRB1P82279 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRB1P82279 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRB1P82279 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRB1P82279 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms