Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMF1P82094 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMF1P82094 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMF1P82094 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMF1P82094 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMF1P82094 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMF1P82094 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMF1P82094 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMF1P82094 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMF1P82094 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMF1P82094 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMF1P82094 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMF1P82094 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMF1P82094 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMF1P82094 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMF1P82094 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMF1P82094 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMF1P82094 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMF1P82094 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMF1P82094 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMF1P82094 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMF1P82094 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMF1P82094 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMF1P82094 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMF1P82094 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMF1P82094 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMF1P82094 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMF1P82094 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMF1P82094 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMF1P82094 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMF1P82094 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMF1P82094 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMF1P82094 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMF1P82094 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMF1P82094 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMF1P82094 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMF1P82094 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMF1P82094 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMF1P82094 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMF1P82094 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMF1P82094 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMF1P82094 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMF1P82094 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMF1P82094 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMF1P82094 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMF1P82094 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMF1P82094 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMF1P82094 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMF1P82094 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMF1P82094 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMF1P82094 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMF1P82094 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMF1P82094 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMF1P82094 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMF1P82094 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMF1P82094 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMF1P82094 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMF1P82094 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMF1P82094 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMF1P82094 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMF1P82094 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMF1P82094 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMF1P82094 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMF1P82094 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMF1P82094 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMF1P82094 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMF1P82094 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMF1P82094 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMF1P82094 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMF1P82094 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMF1P82094 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMF1P82094 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMF1P82094 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMF1P82094 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMF1P82094 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMF1P82094 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMF1P82094 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMF1P82094 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMF1P82094 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMF1P82094 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMF1P82094 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMF1P82094 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMF1P82094 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMF1P82094 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMF1P82094 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMF1P82094 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMF1P82094 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TMF1P82094 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMF1P82094 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMF1P82094 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMF1P82094 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMF1P82094 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMF1P82094 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMF1P82094 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMF1P82094 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMF1P82094 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMF1P82094 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMF1P82094 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMF1P82094 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMF1P82094 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms