Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms