Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms