Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms