Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms