Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms