Protein–RNA interactions for Protein: P55344

LIM2, Lens fiber membrane intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIM2P55344 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIM2P55344 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIM2P55344 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIM2P55344 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIM2P55344 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIM2P55344 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIM2P55344 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIM2P55344 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIM2P55344 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIM2P55344 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIM2P55344 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIM2P55344 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIM2P55344 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIM2P55344 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LIM2P55344 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIM2P55344 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LIM2P55344 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIM2P55344 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIM2P55344 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIM2P55344 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIM2P55344 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIM2P55344 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIM2P55344 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIM2P55344 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIM2P55344 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIM2P55344 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIM2P55344 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIM2P55344 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIM2P55344 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIM2P55344 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIM2P55344 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIM2P55344 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIM2P55344 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIM2P55344 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIM2P55344 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIM2P55344 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIM2P55344 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIM2P55344 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIM2P55344 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIM2P55344 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIM2P55344 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIM2P55344 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIM2P55344 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIM2P55344 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIM2P55344 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIM2P55344 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIM2P55344 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIM2P55344 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIM2P55344 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIM2P55344 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIM2P55344 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIM2P55344 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIM2P55344 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIM2P55344 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LIM2P55344 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIM2P55344 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIM2P55344 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIM2P55344 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIM2P55344 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIM2P55344 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIM2P55344 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIM2P55344 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIM2P55344 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIM2P55344 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIM2P55344 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIM2P55344 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIM2P55344 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIM2P55344 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIM2P55344 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIM2P55344 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIM2P55344 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIM2P55344 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIM2P55344 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIM2P55344 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIM2P55344 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIM2P55344 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIM2P55344 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIM2P55344 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LIM2P55344 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIM2P55344 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIM2P55344 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIM2P55344 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIM2P55344 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIM2P55344 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIM2P55344 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIM2P55344 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIM2P55344 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIM2P55344 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIM2P55344 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIM2P55344 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIM2P55344 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIM2P55344 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIM2P55344 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIM2P55344 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIM2P55344 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIM2P55344 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIM2P55344 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIM2P55344 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIM2P55344 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIM2P55344 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms