Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSMD4P55036 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms