Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms