Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms