Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP4P49662 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP4P49662 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP4P49662 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP4P49662 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP4P49662 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP4P49662 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP4P49662 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP4P49662 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP4P49662 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP4P49662 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP4P49662 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP4P49662 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP4P49662 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP4P49662 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP4P49662 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP4P49662 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP4P49662 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP4P49662 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP4P49662 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP4P49662 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP4P49662 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP4P49662 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP4P49662 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP4P49662 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP4P49662 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP4P49662 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP4P49662 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP4P49662 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP4P49662 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP4P49662 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP4P49662 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP4P49662 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP4P49662 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP4P49662 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP4P49662 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP4P49662 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP4P49662 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP4P49662 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP4P49662 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP4P49662 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP4P49662 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP4P49662 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP4P49662 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP4P49662 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP4P49662 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP4P49662 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP4P49662 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP4P49662 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP4P49662 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP4P49662 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP4P49662 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP4P49662 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP4P49662 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP4P49662 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP4P49662 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP4P49662 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP4P49662 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP4P49662 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP4P49662 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP4P49662 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP4P49662 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP4P49662 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP4P49662 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP4P49662 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP4P49662 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP4P49662 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP4P49662 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP4P49662 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP4P49662 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP4P49662 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP4P49662 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP4P49662 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP4P49662 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP4P49662 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP4P49662 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP4P49662 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP4P49662 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP4P49662 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP4P49662 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP4P49662 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP4P49662 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP4P49662 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP4P49662 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP4P49662 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP4P49662 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP4P49662 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP4P49662 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP4P49662 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP4P49662 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP4P49662 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP4P49662 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP4P49662 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP4P49662 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP4P49662 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP4P49662 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP4P49662 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP4P49662 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP4P49662 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP4P49662 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms