Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 RTKN-209ENST00000484453 820 ntTSL 1 (best)24.26■■□□□ 1.474e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.174e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.964e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.464e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 RTKN-208ENST00000479256 564 ntTSL 517.57■□□□□ 0.44e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 RTKN-207ENST00000472518 1105 ntTSL 1 (best)15.66■□□□□ 0.14e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.731e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.331e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 TFR2-206ENST00000465294 2763 ntTSL 216.56■□□□□ 0.241e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.221e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 RBM14-RBM4-202ENST00000421355 2034 ntTSL 221.71■■□□□ 1.079e-7■■□□□ 13.1
GTF2F1P35269 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.969e-7■■□□□ 13.1
GTF2F1P35269 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.699e-7■■□□□ 13.1
GTF2F1P35269 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.612e-12■■□□□ 13.1
GTF2F1P35269 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.542e-12■■□□□ 13.1
GTF2F1P35269 RBM14-RBM4-204ENST00000511114 523 ntTSL 413.49□□□□□ -0.259e-7■■□□□ 13.1
GTF2F1P35269 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.164e-13■■□□□ 13.1
GTF2F1P35269 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.774e-13■■□□□ 13.1
GTF2F1P35269 PGGHG-206ENST00000476372 2879 ntTSL 219.44■□□□□ 0.72e-7■■□□□ 13.1
GTF2F1P35269 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.347e-7■■□□□ 13.1
GTF2F1P35269 KMT5C-211ENST00000592631 869 ntTSL 320.03■□□□□ 0.87e-7■■□□□ 13.1
GTF2F1P35269 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.757e-7■■□□□ 13.1
GTF2F1P35269 KMT5C-203ENST00000445196 2077 ntTSL 518.86■□□□□ 0.617e-7■■□□□ 13.1
GTF2F1P35269 KMT5C-204ENST00000460956 637 ntTSL 517.39■□□□□ 0.377e-7■■□□□ 13.1
GTF2F1P35269 KMT5C-209ENST00000587442 464 ntTSL 312.92□□□□□ -0.347e-7■■□□□ 13.1
GTF2F1P35269 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.191e-9■■□□□ 13.1
GTF2F1P35269 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.793e-6■■□□□ 13.1
GTF2F1P35269 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.473e-6■■□□□ 13.1
GTF2F1P35269 ZNF692-211ENST00000477070 1521 ntTSL 522.06■■□□□ 1.126e-10■■□□□ 13.1
GTF2F1P35269 PPP2R5C-216ENST00000556086 279 ntTSL 513.18□□□□□ -0.37e-11■■□□□ 13.1
GTF2F1P35269 PPP2R5C-206ENST00000553554 564 ntTSL 59.25□□□□□ -0.937e-11■■□□□ 13.1
GTF2F1P35269 PABPC1L-207ENST00000372824 2223 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.251e-8■■□□□ 13.1
GTF2F1P35269 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.163e-10■■□□□ 13.1
GTF2F1P35269 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.723e-10■■□□□ 13.1
GTF2F1P35269 PPP1R12C-204ENST00000586992 4141 nt17.64■□□□□ 0.419e-7■■□□□ 13.1
GTF2F1P35269 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.967e-12■■□□□ 13.1
GTF2F1P35269 SLC16A3-204ENST00000578522 535 ntTSL 418.68■□□□□ 0.587e-12■■□□□ 13.1
GTF2F1P35269 SYNJ2-205ENST00000449320 680 ntTSL 49.23□□□□□ -0.933e-6■■□□□ 13.1
GTF2F1P35269 SYNJ2-203ENST00000367113 939 ntTSL 28.67□□□□□ -1.023e-6■■□□□ 13.1
GTF2F1P35269 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.73e-8■■□□□ 13.1
GTF2F1P35269 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.138e-7■■□□□ 13.1
GTF2F1P35269 DHCR24-203ENST00000535035 4153 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.438e-7■■□□□ 13.1
GTF2F1P35269 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.791e-7■■□□□ 13
GTF2F1P35269 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.61e-7■■□□□ 13
GTF2F1P35269 NT5DC2-215ENST00000492555 2004 ntTSL 1 (best)20.47■□□□□ 0.871e-7■■□□□ 13
GTF2F1P35269 NT5DC2-201ENST00000307076 2047 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.221e-7■■□□□ 13
GTF2F1P35269 NT5DC2-212ENST00000487779 536 ntTSL 313.62□□□□□ -0.231e-7■■□□□ 13
GTF2F1P35269 ACSL4-206ENST00000502391 802 ntTSL 322.91■■□□□ 1.269e-10■■□□□ 13
GTF2F1P35269 ACSL4-211ENST00000508092 637 ntTSL 420.06■□□□□ 0.89e-10■■□□□ 13
GTF2F1P35269 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.719e-10■■□□□ 13
GTF2F1P35269 ACSL4-208ENST00000504980 573 ntTSL 419.07■□□□□ 0.649e-10■■□□□ 13
GTF2F1P35269 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.049e-10■■□□□ 13
GTF2F1P35269 ACSL4-205ENST00000469857 506 ntTSL 1 (best)13.36□□□□□ -0.279e-10■■□□□ 13
GTF2F1P35269 ACSL4-204ENST00000469796 5225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.149e-10■■□□□ 13
GTF2F1P35269 ACSL4-207ENST00000504383 683 ntTSL 26.86□□□□□ -1.319e-10■■□□□ 13
GTF2F1P35269 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.355e-7■■□□□ 13
GTF2F1P35269 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.895e-7■■□□□ 13
GTF2F1P35269 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.755e-7■■□□□ 13
GTF2F1P35269 U2AF2-208ENST00000592874 849 ntTSL 519.22■□□□□ 0.674e-8■■□□□ 13
GTF2F1P35269 U2AF2-203ENST00000587196 778 ntTSL 316.11■□□□□ 0.174e-8■■□□□ 13
GTF2F1P35269 NOTUM-202ENST00000425009 996 ntTSL 327.03■■□□□ 1.924e-8■■□□□ 13
GTF2F1P35269 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.822e-7■■□□□ 13
GTF2F1P35269 IGF2R-203ENST00000475584 597 ntTSL 316.74■□□□□ 0.272e-12■■□□□ 13
GTF2F1P35269 ZNF146-202ENST00000456324 3780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.65e-8■■□□□ 13
GTF2F1P35269 ZNF146-203ENST00000586094 565 ntTSL 28.43□□□□□ -1.065e-8■■□□□ 13
GTF2F1P35269 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.375e-8■■□□□ 13
GTF2F1P35269 ZNF146-205ENST00000591063 533 ntTSL 25.12□□□□□ -1.595e-8■■□□□ 13
GTF2F1P35269 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.071e-7■■□□□ 13
GTF2F1P35269 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.259e-7■■□□□ 13
GTF2F1P35269 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.249e-7■■□□□ 13
GTF2F1P35269 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.079e-7■■□□□ 13
GTF2F1P35269 RELT-206ENST00000545687 586 ntTSL 425.13■■□□□ 1.612e-6■■□□□ 13
GTF2F1P35269 RELT-205ENST00000544075 744 ntTSL 324.3■■□□□ 1.482e-6■■□□□ 13
GTF2F1P35269 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.452e-6■■□□□ 13
GTF2F1P35269 RCSD1-201ENST00000361496 822 ntTSL 322■■□□□ 1.117e-8■■□□□ 13
GTF2F1P35269 RCSD1-204ENST00000472038 1719 ntTSL 221.35■■□□□ 1.017e-8■■□□□ 13
GTF2F1P35269 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.673e-6■■□□□ 13
GTF2F1P35269 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.62e-6■■□□□ 13
GTF2F1P35269 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.554e-10■■□□□ 13
GTF2F1P35269 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.497e-8■■□□□ 13
GTF2F1P35269 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.437e-8■■□□□ 13
GTF2F1P35269 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.363e-6■■□□□ 13
GTF2F1P35269 GAB2-201ENST00000340149 6052 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.257e-8■■□□□ 13
GTF2F1P35269 HK1-202ENST00000359426 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.394e-10■■□□□ 13
GTF2F1P35269 HK1-201ENST00000298649 3596 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.394e-10■■□□□ 13
GTF2F1P35269 HK1-206ENST00000448642 3868 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.684e-10■■□□□ 13
GTF2F1P35269 GFOD1-201ENST00000379278 1529 ntTSL 1 (best)10.68□□□□□ -0.74e-10■■□□□ 13
GTF2F1P35269 HK1-203ENST00000360289 3961 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.784e-10■■□□□ 13
GTF2F1P35269 FASTK-216ENST00000496663 818 ntTSL 224.39■■□□□ 1.491e-10■■□□□ 13
GTF2F1P35269 FASTK-213ENST00000482806 1826 ntTSL 523.6■■□□□ 1.371e-10■■□□□ 13
GTF2F1P35269 FASTK-205ENST00000461979 720 ntTSL 523.43■■□□□ 1.341e-10■■□□□ 13
GTF2F1P35269 FASTK-215ENST00000489884 1751 ntTSL 1 (best)22.81■■□□□ 1.241e-10■■□□□ 13
GTF2F1P35269 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.211e-10■■□□□ 13
GTF2F1P35269 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.191e-10■■□□□ 13
GTF2F1P35269 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.191e-10■■□□□ 13
GTF2F1P35269 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.611e-10■■□□□ 13
GTF2F1P35269 FASTK-204ENST00000460980 1521 ntTSL 516.87■□□□□ 0.291e-10■■□□□ 13
GTF2F1P35269 POLD1-211ENST00000600746 999 ntTSL 519.07■□□□□ 0.641e-9■■□□□ 13
GTF2F1P35269 POLD1-213ENST00000601098 783 ntTSL 318.83■□□□□ 0.61e-9■■□□□ 13
GTF2F1P35269 POLD1-212ENST00000600859 3474 ntTSL 216.89■□□□□ 0.291e-9■■□□□ 13
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 78.2 ms