Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms