Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTX2P32243 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
OTX2P32243 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTX2P32243 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTX2P32243 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTX2P32243 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTX2P32243 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTX2P32243 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTX2P32243 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTX2P32243 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTX2P32243 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTX2P32243 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
OTX2P32243 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTX2P32243 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTX2P32243 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTX2P32243 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTX2P32243 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTX2P32243 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTX2P32243 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
OTX2P32243 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTX2P32243 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTX2P32243 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTX2P32243 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTX2P32243 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTX2P32243 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTX2P32243 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTX2P32243 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTX2P32243 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
OTX2P32243 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTX2P32243 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
OTX2P32243 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
OTX2P32243 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTX2P32243 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
OTX2P32243 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
OTX2P32243 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTX2P32243 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTX2P32243 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTX2P32243 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTX2P32243 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTX2P32243 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTX2P32243 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTX2P32243 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTX2P32243 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTX2P32243 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTX2P32243 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTX2P32243 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTX2P32243 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTX2P32243 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTX2P32243 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTX2P32243 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTX2P32243 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTX2P32243 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTX2P32243 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTX2P32243 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTX2P32243 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTX2P32243 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTX2P32243 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
OTX2P32243 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTX2P32243 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTX2P32243 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTX2P32243 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
OTX2P32243 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTX2P32243 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTX2P32243 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTX2P32243 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTX2P32243 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTX2P32243 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTX2P32243 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTX2P32243 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTX2P32243 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTX2P32243 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTX2P32243 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTX2P32243 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTX2P32243 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTX2P32243 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
OTX2P32243 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
OTX2P32243 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTX2P32243 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
OTX2P32243 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
OTX2P32243 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTX2P32243 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
OTX2P32243 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTX2P32243 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTX2P32243 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTX2P32243 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTX2P32243 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTX2P32243 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTX2P32243 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTX2P32243 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTX2P32243 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTX2P32243 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTX2P32243 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTX2P32243 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTX2P32243 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTX2P32243 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTX2P32243 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTX2P32243 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTX2P32243 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTX2P32243 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTX2P32243 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms