Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB6P18564 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms