Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPI1P17947 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPI1P17947 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPI1P17947 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPI1P17947 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPI1P17947 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPI1P17947 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPI1P17947 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPI1P17947 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SPI1P17947 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPI1P17947 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SPI1P17947 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPI1P17947 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPI1P17947 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPI1P17947 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SPI1P17947 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPI1P17947 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SPI1P17947 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPI1P17947 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPI1P17947 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPI1P17947 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPI1P17947 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPI1P17947 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPI1P17947 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPI1P17947 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPI1P17947 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPI1P17947 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPI1P17947 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPI1P17947 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SPI1P17947 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPI1P17947 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPI1P17947 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPI1P17947 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPI1P17947 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPI1P17947 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPI1P17947 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPI1P17947 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPI1P17947 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPI1P17947 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPI1P17947 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPI1P17947 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPI1P17947 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPI1P17947 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPI1P17947 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPI1P17947 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPI1P17947 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SPI1P17947 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SPI1P17947 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPI1P17947 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SPI1P17947 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPI1P17947 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPI1P17947 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPI1P17947 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPI1P17947 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPI1P17947 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPI1P17947 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPI1P17947 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPI1P17947 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPI1P17947 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPI1P17947 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPI1P17947 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPI1P17947 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPI1P17947 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPI1P17947 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPI1P17947 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPI1P17947 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPI1P17947 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPI1P17947 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPI1P17947 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPI1P17947 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPI1P17947 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPI1P17947 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPI1P17947 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPI1P17947 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPI1P17947 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPI1P17947 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPI1P17947 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPI1P17947 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPI1P17947 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPI1P17947 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPI1P17947 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPI1P17947 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPI1P17947 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPI1P17947 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPI1P17947 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPI1P17947 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPI1P17947 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPI1P17947 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPI1P17947 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPI1P17947 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPI1P17947 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPI1P17947 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPI1P17947 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPI1P17947 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPI1P17947 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPI1P17947 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPI1P17947 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPI1P17947 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPI1P17947 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPI1P17947 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms