Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms