Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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