Protein–RNA interactions for Protein: P04085

PDGFA, Platelet-derived growth factor subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFAP04085 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFAP04085 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms