Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLIT2O94813 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms