Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 AC027281.2-201ENST00000623856 713 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms