Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8B2A6NJW9 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms