Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms