Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MKLN1Q9UL63 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms