Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms