Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms