Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms