Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms